Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA4DQ92854 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4DQ92854 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms