Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAAF4Q8WXU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DNAAF4Q8WXU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAAF4Q8WXU2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms