Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLEC4DQ8WXI8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLEC4DQ8WXI8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLEC4DQ8WXI8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLEC4DQ8WXI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLEC4DQ8WXI8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLEC4DQ8WXI8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLEC4DQ8WXI8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLEC4DQ8WXI8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms