Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1Q8WVP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMBR1Q8WVP7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms