Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms