Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3RF3Q8TEJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3RF3Q8TEJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms