Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAT3Q8TDW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAT3Q8TDW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms