Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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ZNF398Q8TD17 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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ZNF398Q8TD17 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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ZNF398Q8TD17 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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ZNF398Q8TD17 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF398Q8TD17 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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