Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCER1Q8TC90 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCER1Q8TC90 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCER1Q8TC90 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms