Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD1Q8NHV4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms