Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGE1

OR6C4, Olfactory receptor 6C4, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR6C4Q8NGE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OR6C4Q8NGE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OR6C4Q8NGE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms