Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1BQ8NFD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms