Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPATA4Q8NEY3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms