Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM3Q8NE01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNNM3Q8NE01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM3Q8NE01 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms