Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM35BQ8NCS4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms