Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD53Q8N9V6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms