Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TMCO5AQ8N6Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMCO5AQ8N6Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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