Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC155Q8N6L0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC155Q8N6L0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms