Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LILRA3Q8N6C8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LILRA3Q8N6C8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LILRA3Q8N6C8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms