Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MINDY1Q8N5J2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY1Q8N5J2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY1Q8N5J2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms