Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC24Q8N4L8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC24Q8N4L8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms