Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBARPQ8N350 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBARPQ8N350 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBARPQ8N350 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms