Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCE1Q8N0S2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms