Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IGDCC3Q8IVU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGDCC3Q8IVU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms