Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERC1Q8IUD2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERC1Q8IUD2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERC1Q8IUD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms