Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM25Q86YD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM25Q86YD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM25Q86YD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms