Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LCA5Q86VQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms