Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF1

TSPAN33, Tetraspanin-33, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN33Q86UF1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN33Q86UF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN33Q86UF1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN33Q86UF1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms