Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEGR1Q7Z3B1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEGR1Q7Z3B1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms