Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER4Q7RTX7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER4Q7RTX7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms