Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFVQ71UI9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms