Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBS12Q6ZW61 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms