Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00336Q6ZUF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms