Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC55Q6ZSA7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms