Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC141Q6ZP82 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms