Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT7Q6ZNI0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms