Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNI2Q6ZMN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNI2Q6ZMN8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNI2Q6ZMN8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms