Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA5Q6ZMJ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARA5Q6ZMJ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARA5Q6ZMJ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms