Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINGO4Q6UY18 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINGO4Q6UY18 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1164.8 ms