Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALKAL1Q6UXT8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALKAL1Q6UXT8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms