Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL17Q6UXB2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL17Q6UXB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms