Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C16orf54Q6UWD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C16orf54Q6UWD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms