Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC174Q6PII3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms