Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFWD3Q6PCD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFWD3Q6PCD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms