Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF544Q6NX49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF544Q6NX49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms