Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2Q6NTF9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms