Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNP1Q6NT89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNP1Q6NT89 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms