Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCSD1Q6JBY9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RCSD1Q6JBY9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCSD1Q6JBY9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms