Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RALGAPA1Q6GYQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RALGAPA1Q6GYQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms