Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ANKRD40Q6AI12 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms